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9.206 Treffer

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    EPI-Trans: an effective transformer-based deep learning model for enhancer promoter interaction prediction
    Ahmed, Fatma S. ; Aly, Saleh ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-17
    Online academicJournal
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    SATIN: a micro and mini satellite mining tool of total genome and coding regions with analysis of perfect repeats polymorphism in coding regions
    Carlos Willian Dias Dantas ; Sebastião Rodrigues da Costa Neto ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-14
    Online academicJournal
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    PxBLAT: an efficient python binding library for BLAT
    Li, Yangyang ; Yang, Rendong
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-8
    Online academicJournal
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    Comparing preprocessing strategies for 3D-Gene microarray data of extracellular vesicle-derived miRNAs
    Takemoto, Yuto ; Ito, Daisuke ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-19
    Online academicJournal
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    Leveraging permutation testing to assess confidence in positive-unlabeled learning applied to high-dimensional biological datasets
    Xu, Shiwei ; Ackerman, Margaret E.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-17
    Online academicJournal
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    iGenSig-Rx: an integral genomic signature based white-box tool for modeling cancer therapeutic responses using multi-omics data
    Lee, Sanghoon ; Sun, Min ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-17
    Online academicJournal
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    Assessing transcriptomic heterogeneity of single-cell RNASeq data by bulk-level gene expression data
    Tiong, Khong-Loon ; Luzhbin, Dmytro ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-35
    Online academicJournal
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    Dyport: dynamic importance-based biomedical hypothesis generation benchmarking technique
    Tyagin, Ilya ; Safro, Ilya
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-28
    Online academicJournal
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    PyMulSim: a method for computing node similarities between multilayer networks via graph isomorphism networks
    Cinaglia, Pietro
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-19
    Online academicJournal
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    StatiCAL: an interactive tool for statistical analysis of biomedical data and scientific valorization
    Pace-Loscos, Tanguy ; Gal, Jocelyn ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-11
    Online academicJournal
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    CPMI: comprehensive neighborhood-based perturbed mutual information for identifying critical states of complex biological processes
    Ren, Jing ; Li, Peiluan ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-22
    Online academicJournal
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    CAraCAl: CAMML with the integration of chromatin accessibility
    Schiebout, Courtney ; H. Robert Frost
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-16
    Online academicJournal
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    A deep learning framework for predicting disease-gene associations with functional modules and graph augmentation
    Jia, Xianghu ; Luo, Weiwen ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-14
    Online academicJournal
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    RNA-clique: a method for computing genetic distances from RNA-seq data
    Tapia, Andrew C. ; Jaromczyk, Jerzy W. ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-33
    Online academicJournal
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    Integrating transformers and many-objective optimization for drug design
    Aksamit, Nicholas ; Hou, Jinqiang ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-25
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    dgfr: an R package to assess sequence diversity of gene families
    Laila Viana Almeida ; João Luís Reis-Cunha ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-6
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    bsgenova: an accurate, robust, and fast genotype caller for bisulfite-sequencing data
    Feng, Yance ; Gao, Fei
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-12
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    GATSol, an enhanced predictor of protein solubility through the synergy of 3D structure graph and large language modeling
    Li, Bin ; Ming, Dengming
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-15
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    LinG3D: visualizing the spatio-temporal dynamics of clonal evolution
    Hu, Anjun ; Awino Maureiq E. Ojwang’ ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-01), Heft 1, S. 1-14
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    SEDA 2024 update: enhancing the SEquence DAtaset builder for seamless integration into automated data analysis pipelines
    Reboiro-Jato, Miguel ; Pérez-Rodríguez, Daniel ; et al.
    In: BMC Bioinformatics, Jg. 25 (2024-05-01), Heft 1, S. 1-9
    Online academicJournal
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