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    Benchmarking of analytical combinations for COVID-19 outcome prediction using single-cell RNA sequencing data.
    Cao, Yue ; Ghazanfar, Shila ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-05-01), Heft 3, S. 1-10
    Online academicJournal
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    Machine learning for RNA 2D structure prediction benchmarked on experimental data.
    Justyna, Marek ; Antczak, Maciej ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-05-01), Heft 3, S. 1-9
    Online academicJournal
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    STMHCpan, an accurate Star-Transformer-based extensible framework for predicting MHC I allele binding peptides.
    Ye, Zheng ; Li, Shaohao ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-05-01), Heft 3, S. 1-11
    Online academicJournal
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    Concepts and methods for transcriptome-wide prediction of chemical messenger RNA modifications with machine learning.
    Mateos, Pablo Acera ; Zhou, You ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-05-01), Heft 3, S. 1-14
    Online academicJournal
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    Using traditional machine learning and deep learning methods for on- and off-target prediction in CRISPR/Cas9: a review.
    Sherkatghanad, Zeinab ; Abdar, Moloud ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-05-01), Heft 3, S. 1-25
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    BindingSite-AugmentedDTA: enabling a next-generation pipeline for interpretable prediction models in drug repurposing.
    Yousefi, Niloofar ; Yazdani-Jahromi, Mehdi ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-05-01), Heft 3, S. 1-13
    Online academicJournal
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    Machine learning for synergistic network pharmacology: a comprehensive overview.
    Noor, Fatima ; Asif, Muhammad ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-05-01), Heft 3, S. 1-27
    Online academicJournal
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    SoCube: an innovative end-to-end doublet detection algorithm for analyzing scRNA-seq data.
    Zhang, Hongning ; Lu, Mingkun ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-05-01), Heft 3, S. 1-13
    Online academicJournal
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    FLAN: feature-wise latent additive neural models for biological applications.
    Nguyen, An-Phi ; Vasilaki, Stefania ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-05-01), Heft 3, S. 1-11
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    Collaborative deep learning improves disease-related circRNA prediction based on multi-source functional information.
    Wang, Yongtian ; Liu, Xinmeng ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-03-01), Heft 2, S. 1-14
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    TEINet: a deep learning framework for prediction of TCR–epitope binding specificity.
    Jiang, Yuepeng ; Huo, Miaozhe ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-03-01), Heft 2, S. 1-10
    Online academicJournal
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    Machine learning on protein–protein interaction prediction: models, challenges and trends.
    Tang, Tao ; Zhang, Xiaocai ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023-03-01), Heft 2, S. 1-11
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    Advances in the field of phage-based therapy with special emphasis on computational resources.
    Bajiya, Nisha ; Dhall, Anjali ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023), Heft 1, S. 1-15
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    Prediction of anticancer peptides based on an ensemble model of deep learning and machine learning using ordinal positional encoding.
    Yuan, Qitong ; Chen, Keyi ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023), Heft 1, S. 1-10
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    Benchmarking of computational methods for predicting circRNA-disease associations.
    Lan, Wei ; Dong, Yi ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023), Heft 1, S. 1-22
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    EVlncRNA-Dpred: improved prediction of experimentally validated lncRNAs by deep learning.
    Zhou, Bailing ; Ding, Maolin ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023), Heft 1, S. 1-8
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    Learning with uncertainty to accelerate the discovery of histone lysine-specific demethylase 1A (KDM1A/LSD1) inhibitors.
    Wang, Dong ; Wu, Zhenxing ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023), Heft 1, S. 1-14
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    LncReader: identification of dual functional long noncoding RNAs using a multi-head self-attention mechanism.
    Liu, Tianyuan ; Zou, Bohao ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023), Heft 1, S. 1-10
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    R<superscript>2</superscript>-DDI: relation-aware feature refinement for drug–drug interaction prediction.
    Lin, Jiacheng ; Wu, Lijun ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023), Heft 1, S. 1-12
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    BloodNet: An attention-based deep network for accurate, efficient, and costless bloodstain time since deposition inference.
    Li, Huiyu ; Shen, Chen ; et al.
    In: Briefings in Bioinformatics, Jg. 24 (2023), Heft 1, S. 1-9
    Online academicJournal
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