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    Alternative splicing coupled to nonsense-mediated decay coordinates downregulation of non-neuronal genes in developing mouse neurons
    Zhuravskaya, Anna ; Yap, Karen ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-33
    Online academicJournal
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    Beyond benchmarking and towards predictive models of dataset-specific single-cell RNA-seq pipeline performance
    Fang, Cindy ; Selega, Alina ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-18
    Online academicJournal
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    Evaluation of somatic copy number variation detection by NGS technologies and bioinformatics tools on a hyper-diploid cancer genome
    Masood, Daniall ; Ren, Luyao ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-21
    Online academicJournal
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    An integrated single-cell RNA-seq map of human neuroblastoma tumors and preclinical models uncovers divergent mesenchymal-like gene expression programs
    Chapple, Richard H. ; Liu, Xueying ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-26
    Online academicJournal
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    DNA methylation variations underlie lettuce domestication and divergence
    Cao, Shuai ; Sawettalake, Nunchanoke ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-22
    Online academicJournal
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    Metric multidimensional scaling for large single-cell datasets using neural networks
    Canzar, Stefan ; Van Hoan Do ; et al.
    In: Algorithms for Molecular Biology, Jg. 19 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-12
    Online academicJournal
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    Gene count normalization in single-cell imaging-based spatially resolved transcriptomics
    Atta, Lyla ; Clifton, Kalen ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-25
    Online academicJournal
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    Leaf: an ultrafast filter for population-scale long-read SV detection
    Pan, Chenxu ; Reinert, Knut
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-18
    Online academicJournal
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    CpG island turnover events predict evolutionary changes in enhancer activity
    Kocher, Acadia A. ; Dutrow, Emily V. ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-34
    Online academicJournal
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    FoldPAthreader: predicting protein folding pathway using a novel folding force field model derived from known protein universe
    Zhao, Kailong ; Zhao, Pengxin ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-21
    Online academicJournal
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    Legal aspects of privacy-enhancing technologies in genome-wide association studies and their impact on performance and feasibility
    Brauneck, Alissa ; Schmalhorst, Louisa ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-18
    Online academicJournal
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    LABS: linear amplification-based bisulfite sequencing for ultrasensitive cancer detection from cell-free DNA
    Cui, Xiao-Long ; Nie, Ji ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-18
    Online academicJournal
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    CelFiE-ISH: a probabilistic model for multi-cell type deconvolution from single-molecule DNA methylation haplotypes
    Unterman, Irene ; Avrahami, Dana ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-27
    Online academicJournal
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    Author Correction: The senescent methylome and its relationship with cancer, ageing and germline genetic variation in humans
    Lowe, Robert ; Overhoff, Marita G. ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-4
    Online academicJournal
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    Systematic evaluation with practical guidelines for single-cell and spatially resolved transcriptomics data simulation under multiple scenarios
    Duo, Hongrui ; Li, Yinghong ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-29
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    TMO-Net: an explainable pretrained multi-omics model for multi-task learning in oncology
    Wang, Feng-ao ; Zhuang, Zhenfeng ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-24
    Online academicJournal
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    Predicting gene expression state and prioritizing putative enhancers using 5hmC signal
    Gonzalez-Avalos, Edahi ; Onodera, Atsushi ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-32
    Online academicJournal
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    Structural variant landscapes reveal convergent signatures of evolution in sheep and goats
    Yang, Ji ; Wang, Dong-Feng ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-46
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    DNA methylation patterns of transcription factor binding regions characterize their functional and evolutionary contexts
    Rimoldi, Martina ; Wang, Ning ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-22
    Online academicJournal
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    iIMPACT: integrating image and molecular profiles for spatial transcriptomics analysis
    Jiang, Xi ; Wang, Shidan ; et al.
    In: Genome Biology, Jg. 25 (2024-06-01), Heft 1, S. 1-25
    Online academicJournal
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