Karbapeneme Dirençli Acinetobacter baumannii Suşlarında OXA Tipi Karbapenemaz Genlerinin Dağılımının Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemiyle İncelenmesi.

Objective: Carbapenems are the most important broad spectrum antimicrobials used in the treatment of Acinetobacter baumannii infections, but resistance to carbapenems is increasing worldwide. In this study, we aimed to investigate the distribution of OXA-type carbapenemase genes observed in carbapenem-resistant A. baumannii strains by real-time polymerase chain reaction (PCR) method and to provide epidemiological data. Methods: Between January 2016 and January 2018, 20 carbapenem-resistant A. baumannii strains from clinical specimens were included in the study. DNA isolations were performed, and distribution of OXA-type carbapenemase genes were examined using primers and TaqMan probes specific to genes of OXA-23, OXA-24, OXA-51 and OXA-58 carbapenemases by real-time PCR method. Results: Tigecycline was the best choice for carbapenem-resistant A. baumannii strains, of which 16 (80%) were susceptible to this antimicrobial. blaOXA-51 was detected in all strains, while blaOXA-24 was detected in only 1 (5%) strain. Of 20 strains, 10 showed the presence of blaOXA-23 and blaOXA-51 simultaneously. Conclusions: Simultaneous occurrence of blaOXA-23 and blaOXA-51 is remarkable in terms of distribution of OXA-type carbapenemases in carbapenem-resistant A. baumannii strains. Valuable epidemiological data can be obtained by performing routine surveillance of such strains by means of techniques that can produce fast and reliable results such as real-time PCR. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Amaç: Karbapenemler, Acinetobacter baumannii infeksiyonlarının tedavisinde kullanılan en önemli geniş spektrumlu antibiyotiklerdir. Fakat dünya genelinde karbapenemlere direnç gittikçe artmaktadır. Bu çalışmamızda, karbapenem direnci saptanan A. baumannii suşlarında gözlenen OXA tipi karbapenemaz genlerinin dağılımını, gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemiyle incelemeyi ve epidemiyolojik veri sunmayı amaçladık. Yöntemler: Ocak 2016-Ocak 2018 arasında klinik örneklerden izole edilen karbapeneme dirençli 20 A. baumannii suşu çalışmaya dahil edildi. Bu suşlardan DNA izolasyonları gerçekleştirildi ve OXA-23, OXA-24, OXA-51 ve OXA-58 karbapenemazlarının genlerine spesifik primer ve TaqMan probları kullanılarak gerçek zamanlı PCR yöntemiyle OXA karbapenemaz genlerinin dağılımı incelendi. Bulgular: Karbapeneme dirençli A. baumannii suşlarının 16 (%80)'sının duyarlı olduğu tigesiklin bu suşlara bağlı infeksiyonlar için en iyi seçenekti. Tüm suşlarda blaOXA-51 saptanırken, blaOXA-24 sadece 1 (%5) suşta saptandı. Yirmi suştan 10 (%50)'unda blaOXA-23 ve blaOXA-51 birlikteliği vardı. Sonuçlar: Karbapeneme dirençli A. baumannii suşlarındaki OXA tipi karbapenemazların dağılımında blaOXA-23 ve blaOXA-51 birlikteliğinin daha sık olması dikkati çekmiştir. Gerçek zamanlı PCR gibi hızlı ve güvenilir sonuç çıkartabilecek tekniklerle, böyle dirençli suşların rutin sürveyansları yapıldığında değerli epidemiyolojik veriler elde edilebilir. [ABSTRACT FROM AUTHOR]