SARS-CoV- 2 PCR Döngü Eşik (Ct) Değeri ile Klinik Seyir ve Mortalite İlişkisinin Değerlendirilmesi.

Objective: Multiple factors have been studied in association with disease severity in COVID-19. The cycle threshold (Ct) value of polymerase chain reaction (PCR) can reflect viral load in the specimens. In this study, we aimed to evaluate the effect of the Ct value on clinical course and mortality in COVID-19 patients. Methods: Adult patients who tested positive for SARS-CoV-2 with PCR test and who were hospitalized with COVID-19-related symptoms between August 1, 2020, and November 30, 2020, were included in the study. In addition, Ct value, demographic and clinical data (length of hospital stay, need for admission to intensive care unit (ICU), need for mechanical ventilation (MV), and mortality) were reviewed retrospectively. Results: 117 patients were included in the study. The mean Ct value was 22.374.72 (11.07-34.06). There was no significant difference in the mean Ct values between the patients who needed ICU admission and those who did not. When the patients were evaluated by dividing them into three groups according to their Ct values, as < 20, between 20-24 and >24; there was no significant difference between these three groups in terms of severity of pneumonia, laboratory parameters (D-dimer, Neutrophil/Lymphocyte ratio, C-reactive protein, lymphocyte count), length of hospital stay, need for ICU admission, need for MV and mortality. When the patients were divided into two groups with Ct values as <23.3 and ≥23.3, no significant difference was found between the groups regarding ICU need, MV need, and 28-day mortality rates. Conclusion: Most of the studies in the literature about Ct value and its effect on clinical course indicate that lower Ct values are potentially associated with worse outcomes in COVID-19. However, there are also studies reporting that the Ct value does not reflect the severity of the disease. We did not find a correlation between Ct value and laboratory markers, length of hospital stay, the severity of pneumonia, need for ICU admission or MV, and mortality in COVID- 19 patients in this presented study. [ABSTRACT FROM AUTHOR]

Amaç: Şiddetli akut solunum yolu sendromu virusunun (SARS-CoV-2) neden olduğu koronavirus hastalığı (COVID- 19), asemptomatik infeksiyondan ölümle sonuçlanabilecek şiddetli hastalığa kadar değişen klinik tablolara neden olabilmektedir. Klinik seyrin kötüleşmesine pek çok faktör etki etmektedir. Bu çalışmada, viral yükün göstergesi olabilecek ve SARS-CoV-2 spesifik gerçek zamanlı revers transkriptaz polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) testinde elde edilen döngü eşik ("cycle threshold, Ct") değerinin klinik gidiş ve mortalite üzerine etkisinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Yöntemler: RT-PCR testi, 01 Ağustos - 30 Kasım 2020 tarihleri arasında, hastanemiz tıbbi mikrobiyoloji laboratuvarında çalışıldı. Test sonucu pozitif olan COVID-19 ilişkili semptom ve bulgularla hastaneye yatırılan erişkin 117 hasta çalışmaya alındı. Hastalara ait laboratuvar parametreleri, toraks tomografisi bulguları, yatış süresi, yoğun bakım (YB) ihtiyacı, mekanik ventilatör (MV) ihtiyacı ve mortalite durumları ile tanı anındaki PCR test sonuçlarındaki Ct değerleri kaydedildi. Ardından Ct değeri ile kötü klinik gidiş ve mortalite arasında ilişki olup olmadığı değerlendirildi. Bulgular: Tüm hastaların Ct değeri ortalaması 22.37± 4.72 (11.07-34.06) olarak saptandı. YB ihtiyacı olan ve olmayan hastalar arasında Ct değeri ortalamaları açısından anlamlı fark saptanmadı. Hastalar Ct değerlerine göre <20 olanlar (n=37), 20-24 arasında olanlar (n=38) ve >24 olanlar (n=42) şeklinde üç gruba ayrılarak değerlendirildiğinde; yaş, cinsiyet, komorbidite, pnömoninin şiddeti, D-dimer, nötrofil/lenfosit (N/L) oranı, C-reaktif protein (CRP), lenfosit sayısı gibi laboratuvar parametrelerinin düzeyi, yatış süresi, YB ihtiyacı, MV ihtiyacı ve mortalite açısından bu üç grup arasında anlamlı fark saptanmadı. Ct değeri sınırı <23.3 ve ≥23.3 olarak iki gruba ayrıldığında da YB ihtiyacı, MV ihtiyacı ve 28 gün olan mortalite oranı açısından gruplar arasında anlamlı fark saptanmadı. Sonuçlar: Literatürde, COVID-19 hastalığında tespit edilen Ct değeri ile kötü prognoz ve mortalite ilişkisini inceleyen çeşitli çalışmalarda çelişkili sonuçlar bildirilmiştir. Çalışmaların çoğunda düşük Ct değeri ve hastalık progresyonu arasında ilişki saptandığı bildirilmiş olmasına karşın çalışmamızda Ct değeri ile kötü klinik gidişat, hastalık progresyonunu işaret eden laboratuvar parametreleri, yatış süresi, pnömoni şiddeti, YB ihtiyacı, MV ihtiyacı ve mortalite arasında anlamlı ilişki saptanmadı. [ABSTRACT FROM AUTHOR]