Bromukonazol’ ün Moleküler Etkileşim Mekanizmasının DFT ve Moleküler Kenetleme Yöntemleri İle Açıklanması
In: Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Jg. 27 (2023), Heft 2, S. 266-272
Online
academicJournal
Zugriff:
İnsanlar için kanserojen potansiyeli yüksek olan Bromukonazol fungisitinin kuantum kimyasal hesaplamaları yapılarak yapı karakterizasyonunun aydınlatılmasının yanı sıra DNA proteini (PDB ID: 1BNA) ile moleküler kenetleme analizi yapıldı. Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi (DFT) yöntemi B3LYP fonksiyoneli ve aug-ccpVDZ temel seti kullanılarak Gaussian09 programında optimize edildi. Zamana bağlı DFT (TD-DFT) yöntemi ile HOMO, LUMO enerjileri hesaplandı. Protein veri bankasından 1BNA proteinin kristal yapısı *.pdb formatında temin edildi ve ligandın optimize edilmiş geometrisi kullanılarak ligand ile proteinin etkileşimi AutoDock Vina programında analiz edildi. Moleküler kenetlenme çalışmaları sonucu, ligand-protein bağlanma enerjileri, ligand-protein arasında oluşabilecek hidrojen bağ bölgeleri ve sayısı tespit edilerek moleküler etkileşim mekanizması açıklanmıştır.
Titel: |
Bromukonazol’ ün Moleküler Etkileşim Mekanizmasının DFT ve Moleküler Kenetleme Yöntemleri İle Açıklanması
|
---|---|
Autor/in / Beteiligte Person: | Neslihan Kaya Kınaytürk |
Link: | |
Zeitschrift: | Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Jg. 27 (2023), Heft 2, S. 266-272 |
Veröffentlichung: | Suleyman Demirel University, 2023 |
Medientyp: | academicJournal |
ISSN: | 1308-6529 (print) |
Schlagwort: |
|
Sonstiges: |
|