ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ПРОВЕДЕНИЯ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ДНК ТТV В БИОЛОГИЧЕСКОМ МАТЕРИАЛЕ
In: Гепатология и гастроэнтерология, Jg. 8 (2024), Heft 1, S. 36-41
Online
academicJournal
Zugriff:
Введение. Исследование биологического материала на наличие ДНК TTV методом ПЦР позволяет своевременно оценить функциональное состояние печени и иммунной системы человека. Цель исследования – создание компонентов для проведения ПЦР в режиме реального времени для обнаружения ДНК TTV в биологическом материале. Материал и методы. Проведены конструирование и подбор оптимальных праймеров и зондов с учетом размера (длины) ампликона, температуры отжига, нуклеотидного состава, распределения нуклеотидов по длине праймера, длины праймеров; возможности образования праймерами шпилек и димеров определяли с помощью программ Primer-BLAST/Primer3, FastPCR. Поскольку праймеры, даже абсолютно уникальные для тех или иных последовательностей ДНК, могли отжигаться и на неспецифичных участках, не относящихся к анализируемому гену, нами выполнялась проверка соответствия праймеров последовательностям целевого гена. С этой целью использовали online сервис NCBI Primer BLAST и оценивали локальное попарное выравнивание каждого из праймеров со всеми нуклеотидными последовательностями баз данных Refseq. Результаты. В результате проведенных исследований по подбору оптимальной температуры отжига праймеров, концентраций праймеров, а также подбору оптимальной пары нуклеотидов были определены основные параметры сконструированных праймеров. Выводы. Создан набор для обнаружения и количественной оценки ДНК TTV методом полимеразной цепной реакции с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме реального времени, который стал основой для разработки коммерческой тест-системы.
Titel: |
ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ ПРОВЕДЕНИЯ ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ ДЛЯ ОБНАРУЖЕНИЯ ДНК ТТV В БИОЛОГИЧЕСКОМ МАТЕРИАЛЕ
|
---|---|
Autor/in / Beteiligte Person: | Семенов, В. М. ; Егоров, С. К. ; Лятос, И. А. ; Дмитраченко, Т. И. ; Марченко, А. А. ; Косова, М. С. ; Зенькова, С. К. ; Савочкина, К. А. |
Link: | |
Zeitschrift: | Гепатология и гастроэнтерология, Jg. 8 (2024), Heft 1, S. 36-41 |
Veröffentlichung: | Educational Institution "Grodno State Medical University", 2024 |
Medientyp: | academicJournal |
ISSN: | 2616-5546 (print) ; 2708-5309 (print) |
DOI: | 10.25298/2616-5546-2024-8-1-36-41 |
Schlagwort: |
|
Sonstiges: |
|